RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 USP1O94782 785 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN7P41732 249 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXK1P85037 733 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 PCID2Q5JVF3 399 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 IL22RA1Q8N6P7 574 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPHQ9H3R5 247 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 NOD2Q9HC29 1040 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SENP1Q9P0U3 644 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX13Q9UN79 622 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.74■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 DUX1O43812 170 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM155BO75949 473 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 IPMKQ8NFU5 416 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC45A3Q96JT2 553 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A1Q9NY26 324 aa23.73■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM21Q9UKJ8 722 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX2-8O15522 239 aa23.72■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO1A2P46721 670 aa23.72■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM71Q6P5X7 295 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP36Q96G28 342 aa23.72■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.72■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR1AP61163 376 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.71■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 LGSNQ5TDP6 509 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CASC4Q6P4E1 433 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
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CAPNS1-216ENST00000628306 SCRN2Q96FV2 425 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 PHTF1Q9UMS5 762 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQ67 120 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 MAXP61244 160 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK18Q07002 472 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
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CAPNS1-216ENST00000628306 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 RAET1GQ6H3X3 334 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa23.7■■□□□ 1.38
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CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKL2Q92772 493 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX13Q92968 403 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2M4Q96R27 311 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PAFAH2Q99487 392 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCG8Q9H221 673 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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