RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	FOLH1	Q04609	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	STK40	Q8N2I9	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HUS1	O60921	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KLKB1	P03952	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KRT19	P08727	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TSHR	P16473	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ITGAL	P20701	1170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PAX3	P23760	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	STAT1	P42224	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NUMB	P49757	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RABEP1	Q15276	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BMF	Q96LC9	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ING2	Q9H160	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LINC00473	A8K010	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN5	O00501	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCL21	O00585	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CLDN3	O15551	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TOM1L1	O75674	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	IL33	O95760	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CHRM2	P08172	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CYP11B2	P19099	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LMO2	P25791	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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