RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	FIG4	Q92562	907 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF382	Q96SR6	550 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	MTRR	Q9UBK8	725 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	DHRS7	Q9Y394	339 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CDH23	Q9H251	3354 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	EED	O75530	441 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	GJA1	P17302	382 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CCT8	P50990	548 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	MAPK10	P53779	464 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CPQ	Q9Y646	472 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	FAM234B	A2RU67	622 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	HRH2	P25021	359 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	HMGCL	P35914	325 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	FBXO30	Q8TB52	745 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	KLK8	O60259	260 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	DFNA5	O60443	496 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ALDH1A1	P00352	501 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	LDLR	P01130	860 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	COL6A1	P12109	1028 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	IST1	P53990	364 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	HPCA	P84074	193 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CYP4F8	P98187	520 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	BCL2L1	Q07817	233 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	VEPH1	Q14D04	833 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CHST9	Q7L1S5	443 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	IL26	Q9NPH9	171 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	MYO7A	Q13402	2215 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	RAD51B	O15315	384 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CKM	P06732	381 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	RFC2	P35250	354 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CD97	P48960	835 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CLCN4	P51793	760 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CHRNA6	Q15825	494 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	P2RY12	Q9H244	342 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	HNF1B	P35680	557 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	IMPG1	Q17R60	797 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	HID1	Q8IV36	788 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ULK4	Q96C45	1275 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	IGSF21	Q96ID5	467 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341		H0YJX3	145 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	ACOX3	O15254	700 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	TAPBP	O15533	448 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	B4GAT1	O43505	415 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	SEC22B	O75396	215 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	PGLS	O95336	258 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	GPI	P06744	558 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	HOXD10	P28358	340 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SMTN-222	ENST00000612341	CCR3	P51677	355 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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