RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP11X1B4DZS4 312 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF185O15231 689 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SPOPO43791 374 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 AGTP01019 485 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GSE1Q14687 1217 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NRTNQ99748 197 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB8Q9H765 288 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 C1GALT1Q9NS00 363 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ICE1Q9Y2F5 2266 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL33A6NCF5 533 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 A6NL46 340 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM150CB9EJG8 249 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 DPM1O60762 260 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SRP72O76094 671 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS1P28331 727 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 VAV2P52735 878 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAA1Q13131 559 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A19Q695T7 634 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB2Q8N680 514 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FICDQ9BVA6 458 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PCSK5Q92824 1860 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 A1L4Q6 167 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GSAPA4D1B5 854 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PREPP48147 710 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT33BQ14525 404 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCHD3Q3KNS1 767 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ACVR1CQ8NER5 493 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC42Q96M95 316 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SLAMF7Q9NQ25 335 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CASS4Q9NQ75 786 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SHANK1Q9Y566 2161 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PSTPIP1O43586 416 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ST6GAL1P15907 406 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2A7P20853 494 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LMAN1P49257 510 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 XIAPP98170 497 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 OLIG2Q13516 323 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM14Q14142 442 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 HM13Q8TCT9 377 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SRMSQ9H3Y6 488 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MATN2O00339 956 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 BTN3A3O00478 584 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 BTN3A1O00481 513 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TPM3P06753 285 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PYGMP11217 842 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PRLHRP49683 370 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPSNQ13702 412 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1A4Q13733 1029 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NCF4Q15080 339 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL1Q15170 157 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MED25Q71SY5 747 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LCN9Q8WX39 176 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA2Q96AD5 504 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 APOL2Q9BQE5 337 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GBA3Q9H227 469 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR83Q9NYM4 423 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP10Q9P2G4 905 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MED13Q9UHV7 2174 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf81A6NN90 581 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP14A8MT82 685 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 HACD1B0YJ81 288 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MSL3P1P0C860 447 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 PVRP15151 417 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCKSL1P49006 195 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 GEMP55040 296 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-211ENST00000590874 HPS6Q86YV9 775 aa24.88■■□□□ 1.57
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