RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TOP1MTQ969P6 601 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 EBF4Q9BQW3 602 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PADI3Q9ULW8 664 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 S100GP29377 79 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf183Q5T699 404 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CADM2Q8N3J6 435 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PSMG2Q969U7 264 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF570Q96NI8 536 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 FETUBQ9UGM5 382 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CD247P20963 164 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 NT5EP21589 574 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TUBA1BP68363 451 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TUBA3CQ13748 450 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ULK3Q6PHR2 472 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TUBA1AQ71U36 451 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 NEK7Q8TDX7 302 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PIK3R3Q92569 461 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEH1Q9H213 219 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 GIMD1P0DJR0 217 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MXD1Q05195 221 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 HSPB3Q12988 150 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 RIIAD1A6NNX1 92 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SCGNO76038 276 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 LAMP2P13473 410 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 LMO2P25791 158 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SLC38A4Q969I6 547 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF536O15090 1300 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MSRAQ9UJ68 235 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 OR14I1A6ND48 311 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TFPIP10646 304 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 OGFOD2Q6N063 350 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CLIP4Q8N3C7 705 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MINDY2Q8NBR6 621 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 KELP23276 732 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MTPNP58546 118 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 DTLQ9NZJ0 730 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 XKRYO14609 159 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA6P05013 189 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PRPS2P11908 318 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 IFI30P13284 250 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 IL10RBQ08334 325 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PIGXQ8TBF5 258 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SNX33Q8WV41 574 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 DMAC2Q9NW81 257 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ARL5CA6NH57 179 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A2O15244 555 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 DAOAP59103 153 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MYBPC3Q14896 1274 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 FAM129CQ86XR2 697 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 CCRL2O00421 344 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF10O60809 474 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGDIBP52566 201 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ESAMQ96AP7 390 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 TMC8Q8IU68 726 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 VNN1O95497 513 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 IDSP22304 550 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 VBP1P61758 197 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 LAPTM4BQ86VI4 370 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 ARL5AQ9Y689 179 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GVM2 712 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms