RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SNX12Q9UMY4 172 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf58C9J3I9 102 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AQP9O43315 295 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AVILO75366 819 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SERPIND1P05546 499 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EDN3P14138 238 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GPR176Q14439 515 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TCTE1Q5JU00 501 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IPMKQ8NFU5 416 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DTD1Q8TEA8 209 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 WDR26Q9H7D7 661 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CASZ1Q86V15 1759 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C4AP0C0L4 1744 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0U1RQF3 1178 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM10O14672 748 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TCAPO15273 167 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TLR5O60602 858 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RAC2P15153 192 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FGFR4P22455 802 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GPC1P35052 558 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ENTPD1P49961 510 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP1Q07960 439 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AMHR2Q16671 573 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CA9Q16790 459 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ST3GAL2Q16842 350 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IQCHQ86VS3 1027 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OXR1Q8N573 874 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NANPQ8TBE9 248 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SGTBQ96EQ0 304 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LINGO1Q96FE5 620 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HHATLQ9HCP6 504 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TBL1XO60907 577 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SCGB1D2O95969 90 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA5P08758 320 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NR4A1P22736 598 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UQCRC1P31930 480 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HERVK_113P63132 956 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA9Q16795 377 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM187BQ17R55 369 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RNF212Q495C1 297 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C2CD6Q53TS8 623 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FIGNQ5HY92 759 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SV2AQ7L0J3 742 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM2Q9C040 744 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OPA3Q9H6K4 179 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PHF11Q9UIL8 331 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PSME2Q9UL46 239 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DCLK1O15075 740 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HS6ST1O60243 411 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SNX3O60493 162 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CATP04040 527 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CYBAP13498 195 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CHRM3P20309 590 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V1B2P21281 511 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CNTN1Q12860 1018 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DGCR6Q14129 220 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PGS1Q32NB8 556 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms