RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547352.1

HECTD4-204, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 1,203 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-204ENST00000547352 CSHL1Q14406 222 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF460Q14592 562 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ACAP2Q15057 778 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 MYLK3Q32MK0 819 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 FUT11Q495W5 492 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CARD16Q5EG05 197 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HES3Q5TGS1 186 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CES4AQ5XG92 561 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CHPFQ8IZ52 775 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ERP27Q96DN0 273 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CCDC126Q96EE4 140 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 OLFM1Q99784 485 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 IL17CQ9P0M4 197 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 DEC1Q9P2X7 70 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 XPR1Q9UBH6 696 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 PLXNA2O75051 1894 aa8.6□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 DLX3O60479 287 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 NPHS1O60500 1241 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CCDC22O60826 627 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SLC4A1P02730 911 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 PYGLP06737 847 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SBK3P0C264 359 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CCDC166P0CW27 439 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 KITP10721 976 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CTPS1P17812 591 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CD9P21926 228 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SERPINB3P29508 390 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 FMO4P31512 558 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 HMGCLP35914 325 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SERPINB5P36952 375 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 NNMTP40261 264 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 RASSF2P50749 326 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SUOXP51687 545 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 AQP5P55064 265 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CDKN2DP55273 166 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 DNAJB13P59910 316 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 NCALDP61601 193 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ECT2LQ008S8 904 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CACNG1Q06432 222 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SEMA3AQ14563 771 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ACCSLQ4AC99 568 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 AHI1Q8N157 1196 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 STK40Q8N2I9 435 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 LPGAT1Q92604 370 aa8.59□□□□□ -1.03
HECTD4-204ENST00000547352 SKA1Q96BD8 255 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms