RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 UCMAQ8WVF2 138 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 NTAN1Q96AB6 310 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM136AQ96C01 138 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 FAR2Q96K12 515 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM84AQ96KN4 292 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 GBP5Q96PP8 586 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CENPKQ9BS16 269 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC106Q9BWC9 280 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 VCX3AQ9NNX9 186 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 DKK4Q9UBT3 224 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 VPS28Q9UK41 221 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 KCTD3Q9Y597 815 aa4.7□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ENO4A6NNW6 628 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 H0Y3Z8 333 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 J3KTA2 159 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF103O00237 685 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TOR1BO14657 336 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 DCLK1O15075 740 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TSPAN1O60635 241 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 HUS1O60921 280 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TBX10O75333 385 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 BAIAP3O94812 1187 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PRSS23O95084 383 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 AP2A1O95782 977 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 SPATA31D3P0C874 917 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CSH1P0DML2 217 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CSH2P0DML3 217 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 THRAP10827 490 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 RALBP11234 206 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 JUPP14923 745 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CPA3P15088 417 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNE1P15382 129 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 HK1P19367 917 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CR2P20023 1033 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ITGALP20701 1170 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 MST1P26927 711 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PRKAR1BP31321 381 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 MAGEA12P43365 314 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 RXRGP48443 463 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC1A6P48664 564 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 NUMBP49757 651 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TAF6P49848 677 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TUBP50607 506 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 LIMK2P53671 638 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 LOXL3P58215 753 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 GAD2Q05329 585 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ARHGAP1Q07960 439 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TOMM20Q15388 145 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 MAPRE2Q15555 327 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ZBTB6Q15916 424 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CDO1Q16878 200 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 BTBD16Q32M84 506 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF385BQ569K4 471 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TREML2Q5T2D2 321 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 PMF1Q6P1K2 205 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.69□□□□□ -1.66
CYCSP28-201ENST00000534284 CFAP161Q6P656 301 aa4.69□□□□□ -1.66
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