RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GAREM1Q9H706 876 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR19A6NJB7 356 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BM21 787 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP8B1O43520 1251 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 VCLP18206 1134 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 DGKAP23743 735 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CLCA4Q14CN2 919 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.25■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PTERQ96BW5 349 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SMC6Q96SB8 1091 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SYTL2Q9HCH5 934 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.25■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 DMPKQ09013 629 aa22.24■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 CLEC14AQ86T13 490 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PHC3Q8NDX5 983 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR78Q96P69 363 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP33O14559 1287 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 CD1DP15813 335 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 KCNC1P48547 511 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.157e-7■■■■□ 24.6
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TSNARE1-208ENST00000524325 LRP8Q14114 963 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A45Q8N413 288 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 DLG3Q92796 817 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 ALG9Q9H6U8 611 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 BTN3A1O00481 513 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 FFAR2O15552 330 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.22■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 RETP07949 1114 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 EXT2Q93063 718 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 SCYL1Q96KG9 808 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf66Q96MD2 445 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 DERL2Q9GZP9 239 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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