RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMAN1P49257 510 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1CAP62136 330 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACY1Q03154 408 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DBN1Q16643 649 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PACS1Q6VY07 963 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC89Q8N998 374 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.4■□□□□ 0.22
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAIP1Q8WWC4 291 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PEX13Q92968 403 aa16.4■□□□□ 0.22
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASS4Q9NQ75 786 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.4■□□□□ 0.22
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR6C74A6NCV1 312 aa16.39■□□□□ 0.21
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT-ND3P03897 115 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRSS56P0CW18 603 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF28P17035 718 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXN2P32314 431 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSD11B2P80365 405 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MC1RQ01726 317 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACVR1Q04771 509 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNX1Q13596 522 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC38Q502W7 563 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 D2HGDHQ8N465 521 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SGSM3Q96HU1 749 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC1Q99614 292 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.39■□□□□ 0.21
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.38■□□□□ 0.21
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0754O94854 1291 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FTH1P02794 183 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ETS1P14921 441 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOLR1P15328 257 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRIA1P42261 906 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARL4DP49703 201 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKAA1Q13131 559 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BORAQ6PGQ7 559 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCN9Q8WX39 176 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HDAC10Q969S8 669 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TLR10Q9BXR5 811 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PADI1Q9ULC6 663 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F8W8V4 182 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AP3B1O00203 1094 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKX2-8O15522 239 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APRTP07741 180 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR56A5P0C7T3 313 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLA2G2AP14555 144 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDHA2P29803 388 aa16.37■□□□□ 0.21
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUBB3Q13509 450 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR4L1Q8NH43 312 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR8K5Q8NH50 307 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
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