RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489406.1

UFD1-209, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

TSL 2

Gene UFD1, Length 994 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-209ENST00000489406 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.52□□□□□ -0.09
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UFD1-209ENST00000489406 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
UFD1-209ENST00000489406 POMT2Q9UKY4 750 aa14.52□□□□□ -0.09
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UFD1-209ENST00000489406 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.48□□□□□ -0.09
UFD1-209ENST00000489406 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.48□□□□□ -0.09
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UFD1-209ENST00000489406 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UFD1-209ENST00000489406 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.48□□□□□ -0.09
UFD1-209ENST00000489406 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
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