RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CEP104	O60308	925 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZG16	O60844	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RRAD	P55042	308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ITK	Q08881	620 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	MED25	Q71SY5	747 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PBK	Q96KB5	322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25	6e-9	■■■■■ 47.5
RBM3-208	ENST00000489344	C5AR2	Q9P296	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344		H7C0C1	242 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	KCNK1	O00180	336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	JCHAIN	P01591	159 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	BRAF	P15056	766 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ATP5O	P48047	213 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	GLRB	P48167	497 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SPINT3	P49223	89 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	GPR19	Q15760	415 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SGSM3	Q96HU1	749 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RBP3	P10745	1247 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	MEN1	O00255	615 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	FGG	P02679	453 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RBL1	P28749	1068 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TUBB4B	P68371	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DSC2	Q02487	901 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	IHH	Q14623	411 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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