RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 SH3BP5O60239 455 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ERLIN1O75477 346 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TCEA3O75764 348 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ALPPL2P10696 532 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ACADLP28330 430 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 POU4F1Q01851 419 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TMED2Q15363 201 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 INAVAQ3KP66 663 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SYTL3Q4VX76 610 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ADGRD1Q6QNK2 874 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PDZD3Q86UT5 571 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 NAXDQ8IW45 347 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 NETO1Q8TDF5 533 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 INPP5DQ92835 1189 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TMEM159Q96B96 161 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CAB39LQ9H9S4 337 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 EURLQ9NYK6 297 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC24A2Q9UI40 661 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PSMD13Q9UNM6 376 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 OR52A4PA6NMU1 304 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TM4SF5O14894 197 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN12O95859 305 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC35G4P0C7Q5 338 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MSH2P43246 934 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SERPINB9P50453 376 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 BMPR2Q13873 1038 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 RASA2Q15283 850 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 RPE65Q16518 533 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 C14orf28Q4W4Y0 310 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PAQR3Q6TCH7 311 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TMEM207Q6UWW9 146 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ISL2Q96A47 359 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 APOLD1Q96LR9 279 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CAMK1GQ96NX5 476 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 POPDC3Q9HBV1 291 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A10Q9ULF5 831 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 NFS1Q9Y697 457 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CFAP54Q96N23 3096 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 A0A0G2JNG1 304 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MAZP56270 477 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ZNF460Q14592 562 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 KIR2DS5Q14953 304 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TTLL9Q3SXZ7 439 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MROH9Q5TGP6 573 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 UGT3A1Q6NUS8 523 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 TDRPQ86YL5 185 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 RASGRP3Q8IV61 690 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CPNE9Q8IYJ1 553 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 OR2W6PQ8NHA6 318 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PPCSQ9HAB8 311 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 OR5K4A6NMS3 321 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CBSLP0DN79 551 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MYF5P13349 255 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC2A4P14672 509 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CNTFP26441 200 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CBSP35520 551 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC19A1P41440 591 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 HALP42357 657 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MAGEA12P43365 314 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 FASLGP48023 281 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 USP10Q14694 798 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CYHR1Q6ZMK1 362 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 NEK10Q6ZWH5 1172 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CMC1Q7Z7K0 106 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 IQCKQ8N0W5 287 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 ARL14Q8N4G2 192 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MZB1Q8WU39 189 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 FAM122AQ96E09 287 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CCDC77Q9BR77 488 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 IKBKGQ9Y6K9 419 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 MATN4O95460 622 aa19.47■□□□□ 0.71
ACTB-210ENST00000477812 SLC35E2BP0CK96 405 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms