RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 CLCA4Q14CN2 919 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CROCCP2Q86T23 111 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PTERQ96BW5 349 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 NXNL1Q96CM4 212 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PHOX2BQ99453 314 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 RAB23Q9ULC3 237 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ACOT9Q9Y305 439 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF292O60281 2723 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 LNP1A1A4G5 178 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 KLHL33A6NCF5 533 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 KPNA5O15131 536 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ZBTB14O43829 449 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 MATN4O95460 622 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 MT-ND3P03897 115 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 APOA4P06727 396 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SBK3P0C264 359 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CD1DP15813 335 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ENGP17813 658 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 KRT4P19013 534 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ATP5DP30049 168 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC26A3P40879 764 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC12A2P55011 1212 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 35.4
SLC13A3-209ENST00000468915 MPP2Q14168 576 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 BANPQ8N9N5 519 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SAP25Q8TEE9 199 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 LINGO1Q96FE5 620 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 WWP1Q9H0M0 922 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 VPS11Q9H270 941 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CENPHQ9H3R5 247 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 EMCNQ9ULC0 261 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PROB1E7EW31 1015 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 LMO7DNF2Z398 122 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 F8W8V4 182 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 GFYI3L273 518 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CDC7O00311 574 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 YY2O15391 372 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 AQP9O43315 295 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 TYROBPO43914 113 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 KLHL2O95198 593 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 MPOP05164 745 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF806P0C7X5 589 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CBSLP0DN79 551 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 CBSP35520 551 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 IL2P60568 153 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 IL9RQ01113 521 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 11.3
SLC13A3-209ENST00000468915 CSHL1Q14406 222 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SBSNQ6UWP8 590 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 RAPH1Q70E73 1250 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ISCA2Q86U28 154 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PDZD3Q86UT5 571 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 NAGSQ8N159 534 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 LMX1AQ8TE12 382 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 PATE1Q8WXA2 126 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 TMEM159Q96B96 161 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 DERL2Q9GZP9 239 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 GAREM1Q9H706 876 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 SPASTQ9UBP0 616 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SLC13A3-209ENST00000468915 A0A087X1B8 175 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 KRT87PA6NCN2 255 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 TARM1B6A8C7 271 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 H3BQF6 201 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC13A3-209ENST00000468915 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms