RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT222Q8N1A0 295 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 HM13Q8TCT9 377 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SGSM3Q96HU1 749 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf72Q96LT7 481 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB12Q96P63 405 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TGM7Q96PF1 710 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CTRCQ99895 268 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRY4Q9C004 299 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY12Q9H244 342 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 UCK1Q9HA47 277 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KCND1Q9NSA2 647 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 POT1Q9NUX5 634 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX13Q9UN79 622 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CDYLQ9Y232 598 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN2AQ99250 2005 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT87PA6NCN2 255 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 DUX1O43812 170 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 VAPBO95292 243 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGA2BP08514 1039 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 JMJD7P0C870 316 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A4P14672 509 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF28P17035 718 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEP78395 509 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK16Q00536 496 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TLE3Q04726 772 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKG2Q13237 762 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPUQ71F23 418 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 JAMLQ86YT9 394 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR10G6Q8NH81 332 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ART4Q93070 314 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC45Q96CN5 670 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 BIRC8Q96P09 236 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC30A3Q99726 388 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K3Q99759 626 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CMKLR1Q99788 373 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 STRADBQ9C0K7 418 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 IL22Q9GZX6 179 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PRORYQ9H606 182 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 XKR8Q9H6D3 395 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-206ENST00000461017 BFARQ9NZS9 450 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 OR6C74A6NCV1 312 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP99D6REC4 459 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 BTN3A3O00478 584 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TTI1O43156 1089 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK10O43240 276 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 GPC4O75487 556 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 AP2A2O94973 939 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-206ENST00000461017 TIAF1O95411 115 aa6.82□□□□□ -1.32
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