RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACP5P13686 325 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRK5P34947 590 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTN2P35609 894 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNAR2P48551 515 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLE3Q04726 772 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP2A13Q16696 494 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GEN1Q17RS7 908 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM110Q86TL2 294 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DTX2Q86UW9 622 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL6Q8TCB7 284 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF139Q8WU17 664 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARRDC3Q96B67 414 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHFRQ96EP1 664 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BOD1Q96IK1 185 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPS50Q96JG6 964 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGPAT1Q99943 283 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LHX5Q9H2C1 402 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLOD4Q9HC38 313 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAGE10A6NGK3 116 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN14A8MX76 684 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN9O14815 690 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM24O15164 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLULP15104 373 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FERP16591 822 aa8.5□□□□□ -1.05
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXC13P31276 330 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASP14P31944 242 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACADSBP45954 432 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RUNX3Q13761 415 aa8.5□□□□□ -1.05
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARMC3Q5W041 872 aa8.5□□□□□ -1.05
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC22A25Q6T423 547 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAC4Q86UU9 113 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERICH1Q86X53 443 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB106AQ8N104 65 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMC1Q8N766 993 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF366Q8N895 744 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD180Q99467 661 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPAS1Q99742 590 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECT2Q9H8V3 914 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRF2Q9HAW0 419 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLK2Q9NYY3 685 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WNT16Q9UBV4 365 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LSM8O95777 96 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QTNF9P0C862 333 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GATA3P23771 443 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUMBP49757 651 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SGSHP51688 502 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDSRQ06136 332 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.49□□□□□ -1.05
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