RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454323.1

CUL3-208, Transcript of cullin 3, human

TSL 3

Gene CUL3, Length 688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-208	ENST00000454323	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	EXT2	Q93063	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GFI1	Q99684	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	WNT9B	O14905	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PLPP2	O43688	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KCNK5	O95279	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CTSA	P10619	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NMBR	P28336	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CDC25C	P30307	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DUSP6	Q16828	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KRT39	Q6A163	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	APBB2	Q92870	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	OLFM1	Q99784	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323		A6NNC1	897 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PTGES	O14684	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC30A4	O14863	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NDUFS4	O43181	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	KERA	O60938	352 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	DANCR	P0C864	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	G6PD	P11413	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CHRNB2	P17787	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PIGA	P37287	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	WBP1	Q96G27	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	AK8	Q96MA6	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	FZD8	Q9H461	694 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CUL3-208	ENST00000454323	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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