RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 GCNT4Q9P109 453 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2R1Q13018 1463 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARVCFO00192 962 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CLIC2O15247 247 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AVILO75366 819 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZMPSTE24O75844 475 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ERBB2P04626 1255 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CCR4P51679 360 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPC5P78333 572 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf80Q0P641 193 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KCNAB2Q13303 367 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR1Q13613 665 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ELP2Q6IA86 826 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF529Q6P280 563 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NT5DC3Q86UY8 548 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT13Q86X67 352 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NIPA2Q8N8Q9 360 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CEP76Q8TAP6 659 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PIGQQ9BRB3 760 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GSX2Q9BZM3 304 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CALML5Q9NZT1 146 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 UPB1Q9UBR1 384 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 REREQ9P2R6 1566 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF10O15013 1369 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM94Q12767 1356 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 METTL15A6NJ78 407 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LAD1O00515 517 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SOCS7O14512 581 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PIAS2O75928 621 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP3O75969 853 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ELFN1P0C7U0 828 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FSHRP23945 695 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BDKRB2P30411 391 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH3B2P48448 385 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ARL6IP1Q15041 203 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HLFQ16534 295 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SYTL3Q4VX76 610 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 USP30Q70CQ3 517 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 EFHBQ8N7U6 833 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MARC2Q969Z3 335 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PAFAH2Q99487 392 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM2Q99965 735 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KLQ9UEF7 1012 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RIPK3Q9Y572 518 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPQ1 181 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RNF13O43567 381 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC6O43699 453 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BMP1P13497 986 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CHRM3P20309 590 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DGKAP23743 735 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FPR3P25089 353 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARNTP27540 789 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FMO3P31513 532 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH3B1P43353 468 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CTSWP56202 376 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PFKPQ01813 784 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IKBKEQ14164 716 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.52□□□□□ -1.53
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