RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442343.1

RPSAP40-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP40, Length 891 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP40-201ENST00000442343 MMP12P39900 470 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 FASLGP48023 281 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 MAPKAPK2P49137 400 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 LMAN1P49257 510 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 NDST2P52849 883 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC6A3Q01959 620 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SEMA5AQ13591 1074 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ZSCAN26Q16670 478 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 UGP2Q16851 508 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 CFAP58Q5T655 872 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 KCTD16Q68DU8 428 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ERAP2Q6P179 960 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 BNIPLQ7Z465 357 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 CROCCP2Q86T23 111 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 THAP4Q8WY91 577 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 KAT5Q92993 513 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 HMCESQ96FZ2 354 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 HES6Q96HZ4 224 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 C5orf34Q96MH7 638 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 CPXM1Q96SM3 734 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 LGR4Q9BXB1 951 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 RAB17Q9H0T7 212 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ISCUQ9H1K1 167 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 AMFRQ9UKV5 643 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 TFR2Q9UP52 801 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.33□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 VGLL3A8MV65 326 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 THAP12O43422 761 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 KDELR3O43731 214 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 LRCH4O75427 683 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 FTCDO95954 541 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 CALCAP01258 141 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 PCCBP05166 539 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 FURINP09958 794 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 DRD2P14416 443 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 F8A1P23610 371 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 DLSTP36957 453 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SEPHS1P49903 392 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 PGDP52209 483 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 DEUP1Q05D60 604 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 MANEALQ5VSG8 457 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 AFMIDQ63HM1 303 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ARCQ7LC44 396 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 NLRP14Q86W24 1093 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 NAGSQ8N159 534 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 OR10G6Q8NH81 332 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 TRIM11Q96F44 468 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 TCTN2Q96GX1 697 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 WDR26Q9H7D7 661 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.32□□□□□ -1.4
RPSAP40-201ENST00000442343 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms