RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GPR149Q86SP6 731 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ARRDC3Q96B67 414 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 S100A14Q9HCY8 104 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 E7ENX8 843 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 Q6ZSR9 355 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TERB1Q8NA31 727 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TEX37Q96LM6 180 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FFAR3O14843 346 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GPR42O15529 346 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 IDO1P14902 403 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A2Q01362 244 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RETREG3Q86VR2 466 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PAPLNO95428 1278 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN3P20807 821 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 VHLP40337 213 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CTSCP53634 463 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF570Q96NI8 536 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RDH14Q9HBH5 336 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 K7EPI3 171 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP6O75344 327 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ANXA5P08758 320 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 HMOX2P30519 316 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CDC16Q13042 620 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GBX1Q14549 363 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 OGFOD2Q6N063 350 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GLYATL1Q969I3 302 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LRCH3Q96II8 777 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 KXD1Q9BQD3 176 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 WNT9AO14904 365 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NUAK1O60285 661 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 STK16O75716 305 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 OPRD1P41143 372 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FLOT2Q14254 428 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PDGFRLQ15198 375 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TAF11Q15544 211 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CACUL1Q86Y37 369 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SFRP1Q8N474 314 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ASB11Q8WXH4 323 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FAM129BQ96TA1 746 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN6O43657 245 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ME2P23368 584 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ITGB7P26010 798 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GSTA3Q16772 222 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MUM1Q2TAK8 710 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM74Q86UV6 250 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 JADE3Q92613 823 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PYCR2Q96C36 320 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PARVBQ9HBI1 364 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 AIG1Q9NVV5 245 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 K7ESM1 405 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GJA4P35212 333 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 IL12RB1P42701 662 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 UFM1P61960 85 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SGO1Q5FBB7 561 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms