RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PPM1MQ96MI6 270 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC115Q96NT0 180 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 GUCA1CO95843 209 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB33AQ14088 237 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PAF1Q8N7H5 531 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF145Q96MT1 663 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPHS2Q99611 448 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ASIC5Q9NY37 505 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 USP22Q9UPT9 525 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 AP3M1Q9Y2T2 418 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 AOC2O75106 756 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 OLFM2O95897 454 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 GGT1P19440 569 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 AKT1P31749 480 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 HNF1BP35680 557 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SPAM1P38567 509 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CDH15P55291 814 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 GPR141Q7Z602 305 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 APCDD1Q8J025 514 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SCLYQ96I15 445 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 VPS50Q96JG6 964 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 NTMT1Q9BV86 223 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 H0YAE9 185 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 K7EPI3 171 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CLGNO14967 610 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 EBLN1P0CF75 366 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 BPIP17213 487 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PIK3CGP48736 1102 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 DGKQP52824 942 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBED5Q49AG3 693 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 TTC23LQ6PF05 361 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM46Q7Z4K8 759 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC13A3Q8WWT9 602 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 APOL5Q9BWW9 433 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGEF15O94989 841 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CLDN7O95471 211 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 IGSF6O95976 241 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CBSLP0DN79 551 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 RAP2AP10114 183 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CBSP35520 551 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC22A12Q96S37 553 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 HBEGFQ99075 208 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 PIF1Q9H611 641 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CPQQ9Y646 472 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CA5AP35218 305 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 GNPDA1P46926 289 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 MTPNP58546 118 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SELPLGQ14242 412 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CHRNA6Q15825 494 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 USP51Q70EK9 711 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 NXPE1Q8N323 547 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ITFG1Q8TB96 612 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3GL1Q99961 368 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 GORASP2Q9H8Y8 452 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 CENPFP49454 3210 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ULK1O75385 1050 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms