RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDHA1P08559 390 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MMP8P22894 467 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SSTR2P30874 369 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 NTF4P34130 210 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIR3DL1P43629 444 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CLCNKAP51800 687 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 STC1P52823 247 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TPI1P60174 286 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAXP61244 160 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TUBB4BP68371 445 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDE1BQ01064 536 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACY1Q03154 408 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 IL10RBQ08334 325 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTP4A2Q12974 167 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TUBB2AQ13885 445 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCF4Q15080 339 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDSNQ15517 529 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CA9Q16790 459 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 VWA2Q5GFL6 755 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DCAF10Q5QP82 559 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDR59Q6PJI9 974 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GBP6Q6ZN66 633 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 USP45Q70EL2 814 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 D2HGDHQ8N465 521 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 AVL9Q8NBF6 648 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR150Q8NGU9 434 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 EXD1Q8NHP7 514 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 UBXN4Q92575 508 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SMARCE1Q969G3 411 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ISL2Q96A47 359 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZDHHC12Q96GR4 267 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPM1MQ96MI6 270 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRFN5Q96NI6 719 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 MGME1Q9BQP7 344 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 C11orf70Q9BRQ4 267 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAB33BQ9H082 229 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SP110Q9HB58 689 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CHST11Q9NPF2 352 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 POT1Q9NUX5 634 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DTLQ9NZJ0 730 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.63□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PQ67 120 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PQJ5 194 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TLCD2A6NGC4 264 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ALOX12BO75342 701 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 JRKO75564 520 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 SMC2O95347 1197 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CLDN7O95471 211 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 PYGLP06737 847 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD99P14209 185 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD1EP15812 388 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ERCC2P18074 760 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPD1P21695 349 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 IL4RP24394 825 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 TDGF1P3P51864 188 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ART1P52961 327 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 GSDMDP57764 484 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 BPIFB4P59827 614 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 KRT85P78386 507 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 HSD11B2P80365 405 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 FMO1Q01740 532 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 STIM1Q13586 685 aa4.62□□□□□ -1.67
RNU6-398P-201ENST00000384143 IHHQ14623 411 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms