RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL35Q6PF15 583 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PRELID2Q8N945 189 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SGSM3Q96HU1 749 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TTC1Q99614 292 aa22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC78A2IDD5 438 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 AP2A2O94973 939 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 FAM87AP0C7U9 286 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PLA2G2AP14555 144 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ITIH4Q14624 930 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K3Q99759 626 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.93■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OR5K3A6NET4 321 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 B8ZZF3 427 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 F8W8V4 182 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ACVR1Q04771 509 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 MAP7Q14244 749 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 IL11RAQ14626 422 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 GSE1Q14687 1217 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CYP1B1Q16678 543 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC38Q502W7 563 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 UBXN4Q92575 508 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SLC41A2Q96JW4 573 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 IL22Q9GZX6 179 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 COG4Q9H9E3 785 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 IL17BQ9UHF5 180 aa22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 NKX2-8O15522 239 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 FGF5P12034 268 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TPSB2P20231 275 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 KCNJ1P48048 391 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 NPY2RP49146 381 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TPSAB1Q15661 275 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 DBN1Q16643 649 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OOSP2Q86WS3 158 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SLC35F6Q8N357 371 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ESX1Q8N693 406 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 BFARQ9NZS9 450 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.91■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OR6C74A6NCV1 312 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OR51F1A6NGY5 319 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SPAG6O75602 509 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0754O94854 1291 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 FOLR1P15328 257 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 STAT5AP42229 794 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 GRIA1P42261 906 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 NSG1P42857 185 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 KCNAB1Q14722 419 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PCID2Q5JVF3 399 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 PACS1Q6VY07 963 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 CD180Q99467 661 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 SNX12Q9UMY4 172 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.9■■□□□ 1.26
FAAP20-201ENST00000378543 TIAF1O95411 115 aa22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
FAAP20-201ENST00000378543 ITGB6P18564 788 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms