RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ESAMQ96AP7 390 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 U3KQV3 271 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT2B11O75310 529 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NIPSNAP2O75323 286 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HERVK_113P63132 956 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 KLK6Q92876 244 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-6Q9BXR3 956 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 USP29Q9HBJ7 922 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51F1A6NGY5 319 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 IMPDH1P20839 514 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIA1P42261 906 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSKP43235 329 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 IRF5Q13568 498 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK11Q15759 364 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB6Q15916 424 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MTX3Q5HYI7 312 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 OTUB2Q96DC9 234 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 OSER1Q9NX31 292 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 WWP2O00308 870 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 INPPL1O15357 1258 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 HCRTO43612 131 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MATN4O95460 622 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TFPIP10646 304 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TIE1P35590 1138 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 STAT5AP42229 794 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 IDH3AP50213 366 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMG2Q02383 582 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 UBR7Q8N806 425 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 KDELR3O43731 214 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ALPIP09923 528 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QTNF8P60827 252 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 BEND5Q7L4P6 421 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC38A4Q969I6 547 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SHISA4Q96DD7 197 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT6Q9Y6F9 365 aa16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM159BA6NKW6 160 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TULP3O75386 442 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FABP3P05413 133 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 MTHFRP42898 656 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTR3P61158 418 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 UPP1Q16831 310 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS1R3Q7RTX0 852 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM129CQ86XR2 697 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 H7C0S8 307 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGB4Q8WW32 186 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf34Q96MH7 638 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ACP5P13686 325 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 TYRP14679 529 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RCVRNP35243 200 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 OLR1P78380 273 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNA6Q15825 494 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM171BQ6P995 826 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 HDDC2Q7Z4H3 204 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 POF1BQ8WVV4 589 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 AGPSO00116 658 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAMDEC1O15204 470 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4-201ENST00000344528 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms