RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1W2PRU2 124 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CLDN4O14493 209 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 GPX6P59796 221 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 FPGSQ05932 587 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 VITQ6UXI7 678 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 OR1F1O43749 312 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MED22Q15528 200 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 AHI1Q8N157 1196 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 NATD1Q8N6N6 113 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TTLQ8NG68 377 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM63Q969Q1 353 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.06■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RGS10O43665 173 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RASGRP1O95267 797 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 LAMP2P13473 410 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PQLC3Q8N755 202 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC38A4Q969I6 547 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CYP4F3Q08477 520 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 AMZ2Q86W34 360 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 GKN1Q9NS71 199 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 A8MT66 165 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CHRNGP07510 517 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF30P17039 623 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TOMM20Q15388 145 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 NUS1Q96E22 293 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 TMEM209Q96SK2 561 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CXCR6O00574 342 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RCVRNP35243 200 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ACTR3P61158 418 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC9A5Q14940 896 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 DCST1Q5T197 706 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MBLAC2Q68D91 279 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CBR4Q8N4T8 237 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 AQP12BA6NM10 295 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C9IYK1 514 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 KDELR3O43731 214 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 KIFC1Q9BW19 673 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 IL36AQ9UHA7 158 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 B3GALT6Q96L58 329 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CHST10O43529 356 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ATP12AP54707 1039 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 C1orf74Q96LT6 269 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EPOP01588 193 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PFKMP08237 780 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC11A1P49279 550 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 LSM3P62310 102 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 PDGFRLQ15198 375 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 OR10A6Q8NH74 314 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC3Q9BY71 257 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 EQTNQ9NQ60 294 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 J3KR12 359 aa20.04■□□□□ 0.8
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL12Q53G59 568 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms