RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SPESP1Q6UW49 350 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SVOPLQ8N434 492 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GPR152Q8TDT2 470 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MGME1Q9BQP7 344 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MROQ9BYG7 248 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.69□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MYADML2A6NDP7 307 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PTGES3LE9PB15 166 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 OR7A17O14581 309 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GNGT2O14610 69 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CD52P31358 61 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MAPKAPK2P49137 400 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ZNF691Q5VV52 312 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FRS2Q8WU20 508 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NODALQ96S42 347 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 EXD2Q9NVH0 621 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 HS6ST1O60243 411 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 KATNA1O75449 491 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PRKD3O94806 890 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PRKACGP22612 351 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 OCA2Q04671 838 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CYP4F3Q08477 520 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MGAT3Q09327 533 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MAP2K5Q13163 448 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ABI1Q8IZP0 508 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GTF2H4Q92759 462 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PADI3Q9ULW8 664 aa14.68□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLC12A8A0AV02 714 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NDUFS2O75306 463 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 DNAJB5O75953 348 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PRLP01236 227 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CD9P21926 228 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PSMA3P25788 255 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MC4RP32245 332 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 HPCAL1P37235 193 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PTGR1Q14914 329 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FAM162AQ96A26 154 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 EXOC2Q96KP1 924 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 C8orf48Q96LL4 319 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 UROC1Q96N76 676 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 HMG20AQ9NP66 347 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MTRRQ9UBK8 725 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 A0A0U1RQF3 1178 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 C2orf81A6NN90 581 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IQCF5A8MTL0 148 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CXCR6O00574 342 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TOR1BO14657 336 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IGLV3-27P01718 113 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 DCTP40126 519 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 OXCT1P55809 520 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FAR1Q8WVX9 515 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 C3orf18Q9UK00 162 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 B4GALT3O60512 393 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 JRKO75564 520 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 SLC2A4P14672 509 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PAX3P23760 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 TTPAP49638 278 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 IFITM3Q01628 133 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GTF2H2Q13888 395 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 PERM1Q5SV97 790 aa14.66□□□□□ -0.06
SYP-201ENST00000263233 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms