RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 MATN2O00339 956 aa20.51■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.51■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 LDB2O43679 373 aa20.5■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 PARP6Q2NL67 630 aa20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 AMFRQ9UKV5 643 aa20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 NBASA2RRP1 2371 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 H7C0S8 307 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF75DP51815 510 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 GSDMDP57764 484 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA5AQ13591 1074 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 IGFBP7Q16270 282 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 UGT8Q16880 541 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 COLEC12Q5KU26 742 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.48■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.47■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 GSTM1P09488 218 aa20.47■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 VAV2P52735 878 aa20.47■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 RPA4Q13156 261 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD11Q693B1 232 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 PEX26Q7Z412 305 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 CPT1BQ92523 772 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 PPM1MQ96MI6 270 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.47■□□□□ 0.87
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