RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 CEP97Q8IW35 865 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TSPAN17Q96FV3 270 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GPR21Q99679 349 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 RTKNQ9BST9 563 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SENP1Q9P0U3 644 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GALPQ9UBC7 116 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KCNK6Q9Y257 313 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH14Q0VDD8 3507 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 YY2O15391 372 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 STMN1P16949 149 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 VCLP18206 1134 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CCR7P32248 378 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEA12P43365 314 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB8P50452 374 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC12A2P55011 1212 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 UGT3A1Q6NUS8 523 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 NRROSQ86YC3 692 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 FAM46DQ8NEK8 389 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GIMAP7Q8NHV1 300 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 FAM136AQ96C01 138 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CAMK1GQ96NX5 476 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TIMM29Q9BSF4 260 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 POPDC3Q9HBV1 291 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KLC4Q9NSK0 619 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL42Q9P2K6 505 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GULP1Q9UBP9 304 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 FTSJ1Q9UET6 329 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DHRS7Q9Y394 339 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ACTL7BQ9Y614 415 aa19.1■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL33A6NCF5 533 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 MGAT4DA6NG13 374 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SIGLEC6O43699 453 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 GIMD1P0DJR0 217 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 AOAHP28039 575 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 HPDP32754 393 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PGGT1BP53609 377 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 RAB10P61026 200 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PPP2R2AP63151 447 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CMC1Q7Z7K0 106 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PIP4P1Q86T03 277 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PIM3Q86V86 326 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 AMZ2Q86W34 360 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB124Q8NES8 71 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 OR2L2Q8NH16 312 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CD200R1Q8TD46 325 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 ELMO1Q92556 727 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC30A3Q99726 388 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 DPEP2Q9H4A9 486 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SNX15Q9NRS6 342 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TAAR2Q9P1P5 351 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 PCNX2A6NKB5 2137 aa19.08■□□□□ 0.65
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM38O00635 465 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 KPNA5O15131 536 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 KCNJ13O60928 360 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 RFPL1O75677 317 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 KRT15P19012 456 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 DMPKQ09013 629 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 TUBB8Q3ZCM7 444 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 XKR5Q6UX68 686 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 OTOAQ7RTW8 1153 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB2Q8N680 514 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 HM13Q8TCT9 377 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 INPP5DQ92835 1189 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 GLMNQ92990 594 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 CDC6Q99741 560 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 ST14Q9Y5Y6 855 aa19.08■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 PRR19A6NJB7 356 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 B4DGG1 531 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 TM4SF5O14894 197 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 CRABP2P29373 138 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 TYK2P29597 1187 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 DAB2P98082 770 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF460Q14592 562 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 EVA1BQ9NVM1 165 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 FAM8A1Q9UBU6 413 aa19.07■□□□□ 0.64
HOXD11-201ENST00000249504 ADAM21Q9UKJ8 722 aa19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms