RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 A0A1L1ST33 502 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zp3P10761 424 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PcnaP17918 261 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SykP48025 629 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SirpaP97797 513 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Grin2cQ01098 1239 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 B3gntl1Q3U129 357 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trpc5osQ3UHV4 110 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prrg3Q6PAQ9 231 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Smpd4Q6ZPR5 823 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sytl5Q80T23 753 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adgrd1Q80T32 903 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxw21Q8BI38 468 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Igsf8Q8R366 611 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcf19Q99KJ5 263 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Serpinb11Q9CQV3 388 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cldnd1Q9CQX5 253 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Creb3l4Q9D2A5 370 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdyl2Q9D5D8 503 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr54Q9R0D8 334 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Il18rapQ9Z2B1 614 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pmm2Q9Z2M7 242 aa8.84□□□□□ -0.99
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DgkdE9PUQ8 1220 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r61L7N2B8 865 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nr4a1P12813 601 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gdi1P50396 447 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Matn1P51942 500 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plcl1Q3USB7 1096 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pydc3Q3V3Q4 588 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm11992Q5SS90 291 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MslnQ61468 625 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ugt2a1Q80X89 528 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nars2Q8BGV0 477 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc44a2Q8BY89 706 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim31Q8R0K2 507 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc71Q8VEG0 433 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rgs10Q9CQE5 181 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9CQF4 240 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FopnlQ9CZS3 174 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc25Q9D4B2 624 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oma1Q9D8H7 521 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr45Q9EQQ4 373 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lmx1aQ9JKU8 382 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akap6E9Q9K8 2307 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dock8Q8C147 2100 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Apol11bE9PUZ0 337 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abhd12bG3UZN6 359 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mapk12O08911 367 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc1a6O35544 561 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cxcr3O88410 367 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stam2O88811 523 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01650 108 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01653 108 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt4P07744 525 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spp1P10923 294 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc7a2P18581 657 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LipeP54310 759 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dusp2Q05922 318 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q3TQQ9 903 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ugt3a1Q3UP75 523 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem45aQ60774 273 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcna5Q61762 602 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tatdn1Q6P8M1 295 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prr14Q7TPN9 612 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc9a4Q8BUE1 797 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abi3Q8BYZ1 367 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cuedc1Q8R3V6 388 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dhrs1Q99L04 313 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr55Q9CX97 388 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tor3aQ9ER38 385 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sertad3Q9ERC3 197 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrc31F6VYM1 502 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tex16F6WNY1 1150 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ShdO88834 343 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CblP22682 913 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dlx2P40764 332 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ptchd3Q0EEE2 906 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930480E11RikQ0VG34 394 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cd6Q61003 665 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Phf21aQ6ZPK0 659 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr142Q7TQN9 365 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr538Q7TRT5 310 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clec4b1Q7TS58 209 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mterf4Q8BVN4 346 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Yipf4Q8C407 246 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ItchQ8C863 864 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Camkk1Q8VBY2 505 aa8.83□□□□□ -1
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhb1Q91Y08 818 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms