RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CilpQ66K08 1184 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zpbp2Q6X786 326 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SvopQ8BFT9 548 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppm1nQ8BGL1 404 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Grsf1Q8C5Q4 479 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TbcelQ8C5W3 424 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MmaaQ8C7H1 415 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pex19Q8VCI5 299 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Armc1Q9D7A8 282 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp2c55Q9D816 490 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Angptl2Q9R045 493 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mllt3A2AM29 569 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr742A2RTP5 311 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mgat4eA6H684 439 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec14l5B2RXM5 696 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx43D3Z6P9 646 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r22E9Q7S8 853 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r2L7N2E9 908 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hoxa9P09631 271 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps6P58064 125 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr1bP70700 1135 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OxtrP97926 388 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cog7Q3UM29 770 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clhc1Q5M6W3 596 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CcnhQ61458 323 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Actr3bQ641P0 418 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp324Q78F42 583 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Proser3Q7TSA6 634 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RragdQ7TT45 449 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec24bQ80ZX0 1251 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem184bQ8BG09 407 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lsm1Q8VC85 133 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Camk1Q91YS8 374 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dph2Q9CR25 489 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snx2Q9CWK8 519 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam13cQ9DBR2 601 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rai2Q9QVY8 529 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ProdhQ9WU79 599 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Racgap1Q9WVM1 628 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11758A2BEI6 360 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11757A2BEI8 360 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prrt4B2RU40 902 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Apol11bE9PUZ0 337 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp788E9Q980 884 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r54K7N649 806 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mllt10O54826 1068 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5571P01639 130 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Esr1P19785 599 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BdnfP21237 249 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pxmp2P42925 194 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpx3P46412 226 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccr7P47774 378 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Upp1P52624 311 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 G2e3Q5RJY2 716 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptpn18Q61152 453 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 N4bp1Q6A037 893 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Amer3Q6NS69 780 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HltfQ6PCN7 1003 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem270Q6UJB9 264 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cspg5Q71M36 566 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr798Q7TRH8 311 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr735Q7TRM4 354 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ahcyl1Q80SW1 530 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C2cd4bQ80XU5 340 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DglucyQ8BH86 617 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gbp9Q8BTS3 619 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nat14Q8BVG8 206 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Creb5Q8K1L0 357 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eva1bQ8K2Y3 164 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr342Q8VGK7 312 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ak5Q920P5 562 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wars2Q9CYK1 360 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dusp26Q9D700 211 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ube4bQ9ES00 1173 aa10.06□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930444G20RikD3Z741 495 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp938E9Q9G3 579 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2210016F16RikG3X8U3 338 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r65G3X931 845 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RbpjlO08674 515 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcnk4O88454 398 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PfklP12382 780 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il1rl1P14719 567 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klkb1P26262 638 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Csf2rbP26955 896 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cnr2P47936 347 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Defa8P50706 81 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpv5P69744 723 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrig1P70193 1091 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AnpepP97449 966 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.7 ms