RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CKM	P06732	381 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PCNA	P12004	261 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK6	P29122	969 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PYCR3	Q53H96	274 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FIBCD1	Q8N539	461 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ALG14	Q96F25	216 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FBXL20	Q96IG2	436 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TAPBP	O15533	448 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SOD2	P04179	222 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	BPI	P17213	487 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GJA1	P17302	382 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CD9	P21926	228 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	MERTK	Q12866	999 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GRIK2	Q13002	908 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TRAF3	Q13114	568 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNA6	Q15825	494 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DMTF1	Q9Y222	760 aa		12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	OTC	P00480	354 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TRBC1	P01850	177 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GPI	P06744	558 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF23	P17027	643 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ITGAL	P20701	1170 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HRH2	P25021	359 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RGS4	P49798	205 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GLYAT	Q6IB77	296 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HID1	Q8IV36	788 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	BIRC7	Q96CA5	298 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HAUS8	Q9BT25	410 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	KL	Q9UEF7	1012 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GBF1	Q92538	1859 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GREM1	O60565	184 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	EFEMP2	O95967	443 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NAA20	P61599	178 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	AP1S1	P61966	158 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SNX20	Q7Z614	316 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CHID1	Q9BWS9	393 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC3	Q9BY71	257 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	OCEL1	Q9H607	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	CDH23	Q9H251	3354 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ACOX3	O15254	700 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	NFKBIA	P25963	317 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	GABRR2	P28476	465 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RFC2	P35250	354 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	EPHB3	P54753	998 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	EMX2	Q04743	252 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TPGS2	Q68CL5	300 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	HIC2	Q96JB3	615 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB118	Q96PH6	123 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	OPTC	Q9UBM4	332 aa		12.87	□□□□□ -0.35
BRF1-222	ENST00000635152	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		12.87	□□□□□ -0.35

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