RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 OTX2P32243 289 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGCLP35914 325 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GSE1Q14687 1217 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC14A2Q15849 920 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCHD3Q3KNS1 767 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FNBP1LQ5T0N5 605 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM198BQ6UWH4 519 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CARFQ8N187 725 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1DQ01668 2161 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C9J4A7 227 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINC1P01008 464 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35G4P0C7Q5 338 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MSH3P20585 1137 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRC6AQ5T6X5 926 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 NPNTQ6UXI9 565 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 DDHD1Q8NEL9 900 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TADA1Q96BN2 335 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TRABDQ9H4I3 376 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PCMTD2Q9NV79 361 aa26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPEQ02224 2701 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 GSAPA4D1B5 854 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKUB1A6NFN9 424 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 WIPF3A6NGB9 483 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN8OSP0DMR3 200 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RORAP35398 523 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PREPP48147 710 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NCF4Q15080 339 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LONRF2Q1L5Z9 754 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FIGNQ5HY92 759 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 METRNLQ641Q3 311 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A41Q8N5S1 370 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1L3Q8NH93 324 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 C5AR2Q9P296 337 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PADI2Q9Y2J8 665 aa26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K7O43318 606 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 BUD23O43709 281 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CBX6O95503 412 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF8P28908 595 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCY2Q08462 1091 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA9Q13797 1035 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RFX6Q8HWS3 928 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4E2Q8NGC2 313 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.854e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-217ENST00000629983 UVRAGQ9P2Y5 699 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MED13Q9UHV7 2174 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ALPPP05187 535 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNLT1P63172 113 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC13Q8NBP0 860 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFPM2Q8WW38 1151 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 C1GALT1Q9NS00 363 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM153AQ9UHL3 310 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 POMT2Q9UKY4 750 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSL5Q9ULC5 683 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 PKP3Q9Y446 797 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MGAT4DA6NG13 374 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 POLBP06746 335 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN1P07384 714 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 AGXTP21549 392 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFS1P28331 727 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CA5AP35218 305 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LMAN1P49257 510 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT3AP56704 352 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX44Q53QW1 395 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ODF2Q5BJF6 829 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A4Q6AI14 798 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 TICAM1Q8IUC6 712 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NAT14Q8WUY8 206 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17CQ9P0M4 197 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LCMT1Q9UIC8 334 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SERTAD3Q9UJW9 196 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 LDB2O43679 373 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA4P43681 627 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MESDQ14696 234 aa26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms