RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TEKT5Q96M29 485 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPM1MQ96MI6 270 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TLR10Q9BXR5 811 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DEF6Q9H4E7 631 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRABDQ9H4I3 376 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FANCEQ9HB96 536 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM153AQ9UHL3 310 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC24A2Q9UI40 661 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PKP3Q9Y446 797 aa15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF487B1APH4 448 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y POLBP06746 335 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NFKB1P19838 968 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAPSNQ13702 412 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ITGA9Q13797 1035 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RHOT1Q8IXI2 618 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y OR4E2Q8NGC2 313 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NAT14Q8WUY8 206 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NUDT9Q9BW91 350 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IL17CQ9P0M4 197 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TCFL5Q9UL49 500 aa15.78■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MGAT4DA6NG13 374 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LCA5LO95447 670 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TPM1P09493 284 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RAB40ALP0C0E4 278 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM253P0C7T8 217 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HLA-DPA1P20036 260 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CDH3P22223 829 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CD68P34810 354 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ITGA1P56199 1179 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRKAA1Q13131 559 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LLGL1Q15334 1064 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC6A19Q695T7 634 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KDELC1Q6UW63 502 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DSELQ8IZU8 1212 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IPMKQ8NFU5 416 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF398Q8TD17 642 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DTX3LQ8TDB6 740 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DNAJC7Q99615 494 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NLNQ9BYT8 704 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HACD3Q9P035 362 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACSL5Q9ULC5 683 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.77■□□□□ 0.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.77■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GSAPA4D1B5 854 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM150CB9EJG8 249 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STX7O15400 261 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KRT86O43790 486 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AKR1B10O60218 316 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CEACAM4O75871 244 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DDAH2O95865 285 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COL8A1P27658 744 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PREPP48147 710 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y VAV2P52735 878 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTPRCAPQ14761 206 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KYNUQ16719 465 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CFAP206Q8IYR0 622 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y Q8NA96 180 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LRFN5Q96NI6 719 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LATS2Q9NRM7 1088 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GPR83Q9NYM4 423 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BTRCQ9Y297 605 aa15.76■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NOTCH2Q04721 2471 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAP3K7O43318 606 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRAMEF1O95521 474 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EPOP01588 193 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CYP2A7P20853 494 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RRADP55042 308 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y WASHC5Q12768 1159 aa15.75■□□□□ 0.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ABRQ12979 859 aa15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms