RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	UGT2B4	P06133	528 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GM2A	P17900	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ITIH2	P19823	946 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CYP2A7	P20853	494 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ATIC	P31939	592 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KRT9	P35527	623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LIG3	P49916	1009 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF131	P52739	623 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FOXL2	P58012	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1CA	P62136	330 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	MARK4	Q96L34	752 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SPSB2	Q99619	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.71	□□□□□ -1.65
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772		E9PMD0	336 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SPTLC2	O15270	562 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	WDR1	O75083	606 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ULK1	O75385	1050 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN11	O75508	207 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	GSR	P00390	522 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ALB	P02768	609 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	NUDT7	P0C024	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CBSL	P0DN79	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A16	P16260	332 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CBS	P35520	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ARL4D	P49703	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	AP2B1	P63010	937 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CDK3	Q00526	305 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM14	Q14142	442 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SURF1	Q15526	300 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	EDEM1	Q92611	657 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MSI2-216	ENST00000582772	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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