RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPS1	Q13098	491 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPA4	Q13156	261 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSE1	Q14687	1217 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	NCSTN	Q92542	709 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF778	Q96MU6	729 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR51F1	A6NGY5	319 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501		F8W8V4	182 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF185	O15231	689 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC28A2	O43868	658 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	C9	P02748	559 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	HGF	P14210	728 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	AMD1	P17707	334 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC5A2	P31639	672 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSRP3	P50461	194 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	GNG11	P61952	73 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAME	P78395	509 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR18	Q14330	331 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF534	Q76KX8	674 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	MCU	Q8NE86	351 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	MED8	Q96G25	268 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	PISD	Q9UG56	409 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPTA1	P02549	2419 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501		B4E171	279 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	MLN	P12872	115 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	ITIH1	P19827	911 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	MPST	P25325	297 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD82	P27701	267 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDUFS1	P28331	727 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	ETV5	P41161	510 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	TSPAN7	P41732	249 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAPK9	P45984	424 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAPZB	P47756	277 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD151	P48509	253 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	VPS41	P49754	854 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	CPT1B	Q92523	772 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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