RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC6A20Q9NP91 592 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.13□□□□□ -0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.13□□□□□ -0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GTF3C1Q12789 2109 aa10.12□□□□□ -0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 HBQ1P09105 142 aa10.12□□□□□ -0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 MCCC2Q9HCC0 563 aa10.12□□□□□ -0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 11.1
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ST6GAL1P15907 406 aa10.11□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL1R2P27930 398 aa10.11□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 ART1P52961 327 aa10.11□□□□□ -0.79
CTDNEP1-202ENST00000570380 CTSCP53634 463 aa10.11□□□□□ -0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ACAD10Q6JQN1 1059 aa10.11□□□□□ -0.79
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