RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566135.1

TMX3-208, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, human

TSL 3

Gene TMX3, Length 395 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMX3-208	ENST00000566135	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	OR2A25	A4D2G3	310 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	LRRC72	A6NJI9	287 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	LACTBL1	A8MY62	500 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MAP2K7	O14733	419 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TMCC2	O75069	709 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	ENTPD3	O75355	529 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	RFPL2	O75678	378 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KDM4B	O94953	1096 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	AKR1B1	P15121	316 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SAT1	P21673	171 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	EPHX2	P34913	555 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	FASLG	P48023	281 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	THBS3	P49746	956 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	DLG1	Q12959	904 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KCNC3	Q14003	757 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KCTD2	Q14681	263 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PCLAF	Q15004	111 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	NTRK2	Q16620	822 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	DECR1	Q16698	335 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	NRROS	Q86YC3	692 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TANK	Q92844	425 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TAAR8	Q969N4	342 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PCYT2	Q99447	389 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	CENPO	Q9BU64	300 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TEX12	Q9BXU0	123 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PDE7B	Q9NP56	450 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SIX4	Q9UIU6	781 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PADI3	Q9ULW8	664 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SLX4	Q8IY92	1834 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		3	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	CACNA1S	Q13698	1873 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	ANKRD28	O15084	1053 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MID1	O15344	667 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KCNN4	O15554	427 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PLPP2	O43688	288 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PGM3	O95394	542 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PMS2P2	O95744	297 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SERPINB2	P05120	415 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	LINC00271	P0C7V0	271 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MMP9	P14780	707 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	UGT1A1	P22309	533 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MAP2K2	P36507	400 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	NNMT	P40261	264 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MMP14	P50281	582 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PDLIM4	P50479	330 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SUOX	P51687	545 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	CLDN20	P56880	219 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	DSCR9	P59020	149 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TUBA1B	P68363	451 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PDE1B	Q01064	536 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	TNFAIP1	Q13829	316 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	DLG2	Q15700	870 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	C18orf63	Q68DL7	685 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	OLFM4	Q6UX06	510 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	AACS	Q86V21	672 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	GPR180	Q86V85	440 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TMX3-208	ENST00000566135	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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