RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HIF1AQ16665 826 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NKAIN2Q5VXU1 208 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEPROQ6NW34 567 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP53Q70EK8 1073 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC39Q96DD0 335 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERP44Q9BS26 406 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARD6Q9BX69 1037 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM169AQ9Y6X4 670 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPK9P45984 424 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD151P48509 253 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARL4CP56559 192 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBB2AQ13885 445 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR18Q14330 331 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LONRF1Q17RB8 773 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BBS9Q3SYG4 887 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSS51Q4VC12 460 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYTL3Q4VX76 610 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PANX3Q96QZ0 392 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 P2RY12Q9H244 342 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNX24Q9Y343 169 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AK5Q9Y6K8 562 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TP73O15350 636 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NDUFS1P28331 727 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PREPP48147 710 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LSSP48449 732 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIMK2P53671 638 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GABREP78334 506 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALCOCO2Q13137 446 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CRYMQ14894 314 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHF19Q5T6S3 580 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDZD3Q86UT5 571 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALML6Q8TD86 181 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LPGAT1Q92604 370 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM159Q96B96 161 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB17Q9H0T7 212 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WHRNQ9P202 907 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SATB2Q9UPW6 733 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.67■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC5A10A0PJK1 596 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BANF1O75531 89 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBXN7O94888 489 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDHA2P29803 388 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFHR1Q03591 330 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DUPD1Q68J44 220 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CENPUQ71F23 418 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LSMEM2Q8N112 164 aa21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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