RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.99■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.99■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM234BA2RU67 622 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF197O14709 1029 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AQP4P55087 323 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEMG2Q02383 582 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EMX2Q04743 252 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BNIP2Q12982 314 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAF3Q13114 568 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM240Q5SV17 173 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BADQ92934 168 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC58Q96CX6 371 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDK15Q96Q40 435 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 K7EPI3 171 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR47O94967 919 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSD17B1P14061 328 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VIPR1P32241 457 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MED21Q13503 144 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 Q9H521 79 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DPP7Q9UHL4 492 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AP4S1Q9Y587 144 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC154A6NI56 674 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KPNA5O15131 536 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPPAP01160 153 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHKG1Q16816 387 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMU1Q2TAY7 513 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 Q6ZSR9 355 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NAT14Q8WUY8 206 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MUC13Q9H3R2 512 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMOXQ9NWM0 555 aa20.97■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPAN11A1L157 253 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC28A1O00337 649 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C8GP07360 202 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANXA5P08758 320 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POU2F2P09086 479 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC7A1P30825 629 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCDC1P59894 354 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFYCQ13952 458 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SFRP1Q8N474 314 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PKP2Q99959 881 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1orf50Q9BV19 199 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.96■□□□□ 0.95
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CFAP99D6REC4 459 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FXYD1O00168 92 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NME4O00746 187 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RGS14O43566 566 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KATNA1O75449 491 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPNS1P04632 268 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EBLN1P0CF75 366 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPC1LP0DKB6 136 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPCAMP16422 314 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPB42P16452 691 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AOAHP28039 575 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSPA13P48723 471 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UFM1P61960 85 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDKL1Q00532 357 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B4GALNT1Q00973 533 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRKG2Q13237 762 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NR6A1Q15406 480 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HERVK_113Q902F9 699 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MIEF2Q96C03 454 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.95■□□□□ 0.94
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NTMT1Q9BV86 223 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms