RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 PRR7Q8TB68 274 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 COG1Q8WTW3 980 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 RSC1A1Q92681 617 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 GLYATL1Q969I3 302 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 HDAC11Q96DB2 347 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 LRFN5Q96NI6 719 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 OLFM3Q96PB7 478 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 OR2AG1Q9H205 316 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 FGF21Q9NSA1 209 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 KCND1Q9NSA2 647 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 UBP1Q9NZI7 540 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 A1L4Q6 167 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TLCD2A6NGC4 264 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ARGFXA6NJG6 315 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 KCNN4O15554 427 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TMEM63AO94886 807 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TJP3O95049 919 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TIAF1O95411 115 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 APOC2P02655 101 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 FGGP02679 453 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 RBP3P10745 1247 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ETS1P14921 441 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 BRAFP15056 766 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 FOLR1P15328 257 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 NFKB1P19838 968 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 PTPN3P26045 913 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 DCTP40126 519 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CETN2P41208 172 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CD86P42081 329 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 GDF10P55107 478 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TUBB4BP68371 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 OLIG2Q13516 323 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 LAMB3Q13751 1172 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TUBB2AQ13885 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 GTF2H3Q13889 308 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 GALNT3Q14435 633 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 MED25Q71SY5 747 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 D2HGDHQ8N465 521 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CNTD1Q8N815 330 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TTC13Q8NBP0 860 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 MR1Q95460 341 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 C5orf34Q96MH7 638 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TTC25Q96NG3 672 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 VPS35Q96QK1 796 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 NLNQ9BYT8 704 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.346e-7■■■□□ 16.2
CS-233ENST00000552688 C5AR2Q9P296 337 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SNX7Q9UNH6 387 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 LRRK2Q5S007 2527 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 KLHL33A6NCF5 533 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 ZNF487B1APH4 448 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 MAP3K7O43318 606 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-233ENST00000552688 PMPCBO75439 489 aa6.69□□□□□ -1.34
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