RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 XPR1Q9UBH6 696 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PGRMC2O15173 223 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALT4O60513 344 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 F2P00734 622 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C9P02748 559 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IL7P13232 177 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DRD4P21917 467 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR3A3P47888 321 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RBBP7Q16576 425 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KIF19Q2TAC6 998 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 XKR4Q5GH76 650 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC66Q68CR7 880 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 COMMD7Q86VX2 200 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MREGQ8N565 214 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 WNT8BQ93098 351 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TWNKQ96RR1 684 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 STRADBQ9C0K7 418 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NUAK2Q9H093 628 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TOR3AQ9H497 397 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 S100A14Q9HCY8 104 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ICKQ9UPZ9 632 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PIGNO95427 931 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLATP00750 562 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA4P05014 189 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MYL2P10916 166 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 JUPP14923 745 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A5P22732 501 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G5P39877 138 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 STAT5AP42229 794 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A2P52569 658 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NFKB2Q00653 900 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC12A1Q13621 1099 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2A13Q16696 494 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN21Q16825 1174 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IFNEQ86WN2 208 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 JAMLQ86YT9 394 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SVOPQ8N4V2 548 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 TMCO6Q96DC7 493 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RBBP8Q99708 897 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CD93Q9NPY3 652 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ALS2Q96Q42 1657 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 H7C0S8 307 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 L7N2F9 121 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCL16O15467 120 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FGGP02679 453 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FTH1P02794 183 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SOD2P04179 222 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HOXD13P35453 343 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TUBP50607 506 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX3P56373 397 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 VAMP2P63027 116 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 PON3Q15166 354 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CDONQ4KMG0 1287 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 WSCD1Q658N2 575 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PGAP1Q75T13 922 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AMER2Q8N7J2 671 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TERB2Q8NHR7 220 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ST7LQ8TDW4 575 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ELMO1Q92556 727 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF597Q96LX8 424 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL18Q96ME1 805 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.23□□□□□ -1.41
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