RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 CCDC115Q96NT0 180 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CIB1Q99828 191 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 EGFL8Q99944 293 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ADI1Q9BV57 179 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CIPCQ9C0C6 399 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 IPPKQ9H8X2 491 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PIDD1Q9HB75 910 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SPG21Q9NZD8 308 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ZNF225Q9UK10 706 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CPQQ9Y646 472 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 COL4A6Q14031 1691 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CCDC160A6NGH7 325 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OR7A17O14581 309 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 KPNA5O15131 536 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SLC16A5O15375 505 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 IL6P05231 212 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 C8GP07360 202 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ANXA6P08133 673 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ANXA5P08758 320 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OR56A5P0C7T3 313 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ACPPP15309 386 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CTPS1P17812 591 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 MAPK1P28482 360 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ZNF33BQ06732 778 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 EPS8Q12929 822 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SP140Q13342 867 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 IMPG1Q17R60 797 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 TCTN1Q2MV58 587 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 Q6ZSR9 355 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 NXPE1Q8N323 547 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ELMOD1Q8N336 334 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SFRP1Q8N474 314 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 OR2T11Q8NH01 316 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 FIBINQ8TAL6 211 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CGREF1Q99674 301 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 NTMT1Q9BV86 223 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CD244Q9BZW8 370 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 DPY30Q9C005 99 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CEP44Q9C0F1 390 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 NANOGQ9H9S0 305 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 RAD18Q9NS91 495 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ASPDHA6ND91 283 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 AGAP14A8MT82 685 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 H0YAE9 185 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 QSOX1O00391 747 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 GREM1O60565 184 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 ULK1O75385 1050 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 FGF19O95750 216 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 HPRP00739 348 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 LRG1P02750 347 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-205ENST00000546891 CKMP06732 381 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms