RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 BIN1O00499 593 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC19A2O60779 497 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 FOSL1P15407 271 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PREPP48147 710 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ADCY2Q08462 1091 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 STX1AQ16623 288 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF599Q96NL3 588 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.93□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 DAPK3O43293 454 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 EPHB1P54762 984 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PTP4A2Q12974 167 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 GALNT3Q14435 633 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ALS2CLQ60I27 953 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 RFX8Q6ZV50 586 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CHKBQ9Y259 395 aa14.92□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 F10P00742 488 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 C8BP07358 591 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 LMAN1P49257 510 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CEBPEQ15744 281 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 EID2BQ96D98 161 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 LHPPQ9H008 270 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 LIME1Q9H400 295 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.91□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 E7EQ34 232 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PRLP01236 227 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CTSBP07858 339 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CHRNB2P17787 502 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CDH3P22223 829 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 HTR7P34969 479 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 HALP42357 657 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 CASP6P55212 293 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 MFAP5Q13361 173 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 LONRF1Q17RB8 773 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 OOSP2Q86WS3 158 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 NT5MQ9NPB1 228 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 MEMO1Q9Y316 297 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 PCM1Q15154 2024 aa14.9□□□□□ -0.02
CLSTN3-216ENST00000545663 SOCS6O14544 535 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNHIT1O43257 154 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 MAFKO60675 156 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ST6GAL1P15907 406 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 MMP13P45452 471 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 TNFSF10P50591 281 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ADAM8P78325 824 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ARG2P78540 354 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 RBPJQ06330 500 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 BIVMQ86UB2 503 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR26Q8NDV2 337 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 GLYATL1Q969I3 302 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ARSGQ96EG1 525 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 NRTNQ99748 197 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 VPS16Q9H269 839 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 ABI3Q9P2A4 366 aa14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.88□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 HCRTR1O43613 425 aa14.88□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK14O94921 469 aa14.88□□□□□ -0.03
CLSTN3-216ENST00000545663 GPR89BP0CG08 455 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms