RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528773.1

SUSD1-208, Transcript of sushi domain containing 1, human

TSL 4

Gene SUSD1, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUSD1-208	ENST00000528773	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773		A0A0J9YYE9	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773		A0A1B0GTL3	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF185	O15231	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CCP110	O43303	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CP	P00450	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	PRL	P01236	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TRBC1	P01850	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	MME	P08473	750 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	PDHA1	P08559	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	EDN3	P14138	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SLC2A4	P14672	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF30	P17039	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TYRP1	P17643	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CA5A	P35218	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SCNN1B	P51168	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	RENBP	P51606	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	PPP1CA	P62136	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TUBB4B	P68371	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	FMO1	Q01740	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TUBB3	Q13509	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CA9	Q16790	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	COX20	Q5RI15	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	UBXN4	Q92575	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUSD1-208	ENST00000528773	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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