RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SLC22A12	Q96S37	553 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	WDR62	O43379	1518 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	OR6C76	A6NM76	312 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	OGG1	O15527	345 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DCX	O43602	365 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	HIST1H2AB	P04908	130 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	NOV	P48745	357 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PRKAA1	Q13131	559 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	P2RY6	Q15077	328 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MED22	Q15528	200 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MEP1A	Q16819	746 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ALS2CL	Q60I27	953 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	RFFL	Q8WZ73	363 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TBATA	Q96M53	351 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SYT11	Q9BT88	431 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MIOS	Q9NXC5	875 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ADAMTS12	P58397	1594 aa		3.85	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SERINC4	A6NH21	518 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SCAMP1	O15126	338 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TMCC2	O75069	709 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	AGR2	O95994	175 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TYMP	P19971	482 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	KCNJ10	P78508	379 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	BMPER	Q8N8U9	685 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	IFT140	Q96RY7	1462 aa		3.84	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		3.84	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		3.84	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		3.84	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		3.84	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057		A0A087WW49	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	LIPT2	A6NK58	231 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM63A	O94886	807 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	AP2A2	O94973	939 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	CEBPB	P17676	345 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.83	□□□□□ -1.8
COPS5-208	ENST00000519057	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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