RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-287P-201ENST00000516230 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZANQ9Y493 2812 aa0.15□□□□□ -2.38
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARID1AO14497 2285 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0G2JLM5 398 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERPINE3A8MV23 424 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PI4K2BG5E9Z4 385 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IRAK2O43187 625 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASNA1O43681 348 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 DFNA5O60443 496 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLA2G6O60733 806 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SH3BGRLO75368 114 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALDH1L1O75891 902 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 BMP10O95393 424 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MLYCDO95822 493 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGKV2D-28P01615 120 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPIP06744 558 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSF1P09603 554 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 IRF1P10914 325 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPS2P15880 293 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 UGT1A1P22309 533 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTPN3P26045 913 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GIFP27352 417 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHRNA3P32297 505 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHMT1P34896 483 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLCN4P51793 760 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 AP2B1P63010 937 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SORDQ00796 357 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MCL1Q07820 350 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MFAP5Q13361 173 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PDCLQ13371 301 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAE1Q13564 534 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 EBI3Q14213 229 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 VEPH1Q14D04 833 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAF13Q15543 124 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAF11Q15544 211 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM209BQ5JX69 171 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MARC1Q5VT66 337 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 REG3GQ6UW15 175 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIF6Q6ZMV9 814 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q75L30 129 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 G2E3Q7L622 706 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHMP1BQ7LBR1 199 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF554Q86TJ5 538 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM160B2Q86V87 743 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM131BQ86XD5 332 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFAND4Q86XD8 727 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSCBQ8IWL3 235 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4N5Q8IXE1 308 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 EID3Q8N140 333 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYCT1Q8N699 235 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TPRX1Q8N7U7 411 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYRIPQ8NFW9 859 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 KBTBD8Q8NFY9 601 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR6S1Q8NH40 331 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HUS1BQ8NHY5 278 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 OLIG1Q8TAK6 271 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAPK15Q8TD08 544 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPP4R1Q8TF05 950 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM122AQ96E09 287 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SGF29Q96ES7 293 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNFT2Q96EX2 444 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MASTLQ96GX5 879 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC41A2Q96JW4 573 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF597Q96LX8 424 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMC6Q96SB8 1091 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGMNQ99538 433 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATF6BQ99941 703 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM110AQ9BQ89 295 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBAC1Q9BSL1 405 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 MXD3Q9BW11 206 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 HES7Q9BYE0 225 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 PANK2Q9BZ23 570 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP44Q9H0E7 712 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNMDQ9H2S6 317 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC32A1Q9H598 525 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 NTN4Q9HB63 628 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHST12Q9NRB3 414 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT84Q9NSB2 600 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF69Q9UC07 566 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCND3Q9UK17 655 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC39A10Q9ULF5 831 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB26Q9ULW5 256 aa0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms