RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OR52J3Q8NH60 311 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 KATNBL1Q9H079 304 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TREX1Q9NSU2 369 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C3orf18Q9UK00 162 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC13A4Q9UKG4 626 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FBP2O00757 339 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ESR1P03372 595 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GPIP06744 558 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP2A7P20853 494 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OXTRP30559 389 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PTGER3P43115 390 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS6KA3P51812 740 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 NAA20P61599 178 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MYBPC1Q00872 1141 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNG1Q06432 222 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CHRNA6Q15825 494 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CARTPTQ16568 116 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PAGE3Q5JUK9 113 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 USP45Q70EL2 814 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RETREG3Q86VR2 466 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FIBCD1Q8N539 461 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF540Q8NDQ6 660 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC13A3Q8WWT9 602 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C8orf48Q96LL4 319 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CGREF1Q99674 301 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C7orf72A4D263 438 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM247A6NEH6 219 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 LOC730098B7Z3J9 87 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 EPN2O95208 641 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GLUD1P00367 558 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SERPINB10P48595 397 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4D2P58180 307 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MARVELD2Q8N4S9 558 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TRPV1Q8NER1 839 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNN1Q92952 543 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMBIM1Q969X1 311 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC3Q9BY71 257 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC14AQ9UNH5 594 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF11Q9Y3C5 154 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf78A6NCI8 922 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BNX3 289 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DFNA5O60443 496 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ELK4P28324 431 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 STT3AP46977 705 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 NR1D2Q14995 579 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 UGT2A3Q6UWM9 527 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF111Q6ZNA4 994 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB2Q8N680 514 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HIPK3Q9H422 1215 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SMOXQ9NWM0 555 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTR3BQ9P1U1 418 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 COCHO43405 550 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CAPGP40121 348 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 NAE1Q13564 534 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HID1Q8IV36 788 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 BOCQ9BWV1 1114 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM39AQ9NV64 488 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 AQP12BA6NM10 295 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TFAP2AP05549 437 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ENTPD1P49961 510 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DGKEP52429 567 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR17Q13304 367 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SEMA3AQ14563 771 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CLLU1OSQ5K130 101 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GALNT10Q86SR1 603 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 AQP12AQ8IXF9 295 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf74Q96LT6 269 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MUS81Q96NY9 551 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 REEP1Q9H902 201 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX6Q9UNH7 406 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HAS3O00219 553 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 B4GAT1O43505 415 aa12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms