RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CHMP5Q9NZZ3 219 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PCSK5Q92824 1860 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DYTNA2CJ06 578 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CCDC66A2RUB6 948 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GSAPA4D1B5 854 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AGPSO00116 658 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF749O43361 778 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FAM155BO75949 473 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ATP1A3P13637 1013 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CD99P14209 185 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HLA-DPA1P20036 260 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AMPD1P23109 780 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MIPP30301 263 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PBX1P40424 430 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 LMAN1P49257 510 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF165P49910 485 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ART1P52961 327 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ARG2P78540 354 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TLE4Q04727 773 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 INAQ16352 499 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RPE65Q16518 533 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OR1L3Q8NH93 324 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NR4A3Q92570 626 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HSPH1Q92598 858 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 C14orf79Q96F83 325 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 C12orf66Q96MD2 445 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PEBP4Q96S96 227 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NUP85Q9BW27 656 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CLSTN2Q9H4D0 955 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PARVAQ9NVD7 372 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CDC23Q9UJX2 597 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 POMT2Q9UKY4 750 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MASP2O00187 686 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PCDH17O14917 1159 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OR2B3O76000 313 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 UNC5CO95185 931 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MSL3P1P0C860 447 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AGAP20933 346 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NDUFS1P28331 727 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CA7P43166 264 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PPP2R2AP63151 447 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OGDHQ02218 1023 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GALNT3Q14435 633 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GSE1Q14687 1217 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SLC9A5Q14940 896 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DPYSL2Q16555 572 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 QPCTQ16769 361 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CCDC122Q5T0U0 273 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 C1orf189Q5VU69 101 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MCOLN2Q8IZK6 566 aa5.97□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TEX26Q8N6G2 289 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms