RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 E5RI56 91 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 DKK1O94907 266 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PHBP35232 272 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CD151P48509 253 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 MAZP56270 477 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 NAT14Q8WUY8 206 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 C9orf72Q96LT7 481 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.12■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 EML2O95834 649 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 VIPP01282 170 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 NDUFS1P28331 727 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ECHS1P30084 290 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SSTR1P30872 391 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 FMO4P31512 558 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 NR1D2Q14995 579 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CTSL3PQ5NE16 218 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PATE1Q8WXA2 126 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 KCNJ9Q92806 393 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC74AQ96AQ1 378 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 WWP1Q9H0M0 922 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ABCG4Q9H172 646 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 UCK1Q9HA47 277 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TXNDC16Q9P2K2 825 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.11■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 BRAFP15056 766 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CHRM3P20309 590 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 MPP1Q00013 466 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 NAB1Q13506 487 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PDZD3Q86UT5 571 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 NFU1Q9UMS0 254 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.1■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 HAUS5O94927 633 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 MYF5P13349 255 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 AOAHP28039 575 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TNFRSF8P28908 595 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 EPHA4P54764 986 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 C12orf66Q96MD2 445 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC38A3Q99624 504 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.09■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 IQCF5A8MTL0 148 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 VPS26AO75436 327 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GPC4O75487 556 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TCEA3O75764 348 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ITGB6P18564 788 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ATP5DP30049 168 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CCR7P32248 378 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GPX6P59796 221 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GPLD1P80108 840 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CLCA4Q14CN2 919 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 RPE65Q16518 533 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC157Q569K6 752 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 KRT222Q8N1A0 295 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms