RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 SCRG1O75711 98 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 PROSCO94903 275 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CBX6O95503 412 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 DDAH2O95865 285 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 MX2P20592 715 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 HSD11B2P80365 405 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TYRO3Q06418 890 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 AP1B1Q10567 949 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 RAPSNQ13702 412 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRCAPQ14761 206 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TLR1Q15399 786 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 NFKBIBQ15653 356 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNA6Q15825 494 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SLC6A19Q695T7 634 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 AMZ2Q86W34 360 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 GDAP1Q8TB36 358 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 VPS35Q96QK1 796 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 RAD18Q9NS91 495 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 OR6C74A6NCV1 312 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 OR5K3A6NET4 321 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 OR2AG2A6NM03 316 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 MEN1O00255 615 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 DPM1O60762 260 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 KCNJ13O60928 360 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 PMPCBO75439 489 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM63AO94886 807 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 NDST3O95803 873 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 LDLRP01130 860 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 RORAP35398 523 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 HALP42357 657 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINB4P48594 390 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ARL4DP49703 201 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TUBB4BP68371 445 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 PDE1BQ01064 536 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 DMPKQ09013 629 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ABRQ12979 859 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TUBB2AQ13885 445 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 METRNLQ641Q3 311 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 KMT5CQ86Y97 462 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 DSELQ8IZU8 1212 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 OR1L3Q8NH93 324 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 WWP1Q9H0M0 922 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 GLOD4Q9HC38 313 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 CBX8Q9HC52 389 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 TCFL5Q9UL49 500 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 NENFQ9UMX5 172 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CTPS1-208ENST00000479480 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 TLCD2A6NGC4 264 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 ENO4A6NNW6 628 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 F5H423 210 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 SERPING1P05155 500 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 VCLP18206 1134 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 HMGCLP35914 325 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNA4P43681 627 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-208ENST00000479480 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms